Sim, é possível realizar este controle no TopAcesso. Para isto, é necessário criar zonas de tempo distintas, e depois vinculá-las ao perfil de acesso. Conforme exemplo do print abaixo:
No exemplo acima, o funcionário vinculado a este perfil de acesso, pode acessar o local refeitório três vezes no horário do café, almoço e jantar.